Moin Michael,
also ich mache das so:
Zwei physikalische Platten (je 1TB).
Die eine ist nur für Daten, und hat eine Partition (1TB), die andere hat eine 200GB-Partition für System und Programme, und den Rest wieder für Daten.
Auf den Datenpartitionen wird dann alles mit Hilfe nummerierter Verzeichnisse sortiert.
Z.B. "01 Downloads\01 Browser", "70 Sourcen\01 Delphi 7"
Durch die Nummerierung kann man dann schön die Reihenfolge bestimmen.
Beispielsweise enthalten alle Verzeichnisse, die mit 7x beginnen Daten für die Entwicklung.
Dank der zwei physikalischen Platten, kann ich einfach mit Robocopy-Jobs eine, grobe, Datensicherung von der einen auf die andere Platte machen (dass das keine richtige Sicherung ist, ist mir klar, aber dafür habe ich auch noch DVD-
RAM 
)
Wenn man zwei Platten verwendet, sollte man darauf achten, dass diese nicht aus der gleichen Produktionscharge stammen, da so die Chance recht gross ist, dass nicht beide Platten gleichzeitig ausfallen.