RSnapshot benötigt auf dem zu sichernden Rechner (GNU?) RSync. Mit den Windows-Ablegern von RSync scheint das ganze nicht so ganz zu klappen (laut dem, was ich gelesen habe. Habs deshalb selber noch nicht getestet). Dachte halt du hättest beide Partitionen in einem Rechner, aber ja, "zweier Rechner". Wer lesen kann...
Und ja, Attribute sind so ne Sache. Bei EXT3/EXT4 wird zumindest wohl alles 1:1 mit UID/GID und Zugriffsrechten übernommen, ob das auch für andre Typen gilt weis ich nicht. Zumindest muss die Zielpartition das können -> NTFS als Quelle wäre problematisch, wenn man die Attribute noch braucht.
Zum Zurückholen beliebiger Dateien oder eben eines kompletten Sicherungsstandes müsste halt wirklich nur ein komplette Ordner zurückkopiert werden. Und das sind wie gesagt stink normale Ordner.
Grüße,
Chris