Konnte es vorübergehend lösen indem ich "TActionManager.SaveToFile" nach dem schließen des CustomizeDlg rauskommentiert habe.(das hat bis jetzt immer funktioniert)
Ich wäre trotzdem dankbar wenn hier jemand erklären könnte woran es lag.
Ich benutze das Ding in den meisten größeren Projekten - wär halt blöd, wenn die auf einmal alle anfangen rumzumeckern...