Die CFG-Dateien kannst du getrost weglassen, die werden vor jedem Compilieren aus der
IDE neu erzeugt. Die
DOF-Dateien würde ich auch weglassen und das Problem mit den Compiler-Schaltern usw. mit einem dedizierten Build lösen (ich kann da FinalBuilder sehr empfehlen!). Das sorgt z.B. auch dafür, daß nicht versehentlich mal eine EXE mit Debug-Informationen raus geht.