Ich nehme mal an, du möchtest einfach, dass das Passwort nicht mehr im Klartext sichtbar ist. In diesem Fall kannst du es mit Base64 oder ROT13 kodieren - es steht dann nicht mehr im Klartext in der Datei. Wird das Passwort im Klartext nicht mehr gebraucht, kannst du auch MD5 oder SHA1 nehmen.
Die Einstellungenn würde ich im Klartext lassen. Dass das Programm evtl. abstürzt wenn man in der Konfiguration manuell herumpfuscht sollte jedem klar sein, der das macht. Aber manchmal isses praktisch, wenn man die Einstellungen auch mit einem Texteditor verändern kann.
Siehe übrigens auch dieser Thread im
DF:
http://www.delphi-forum.de/viewtopic.php?t=93172 