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[himitsu]

können die Unterverzeichnisse wenigstens Alphabetisch sortiert sein, bzw. können die sogar in 'ner anderen womöglich anders "sortierten" Reinfolge sein, oder müssen die auch in ihrer
Reinfolge bleiben?

wenn die Unterverzeichnisse auch in ihrer Reinfolge bleiben sollen,
dann wär's wohl am Einfachsten das Ganze in 'nen Baum zu zerlegen und danach neu wieder zusammenzusetzen.