Rein theoretisch müsstest du auch mit einem Hexeditor, der die Sektoren direkt editieren kann, (
HxD) aus Windows heraus möglich sein, die Platte zu kopieren, aber das ist vielleicht ein wenig die hardcore Variante, ansonsten würde es auch mit der
WinApi recht leicht programmierbar sein (Sektor Platte 1 lesen, auf Platte 2 schreiben), aber das Einfachste dürfte, wie genannt, sein ein fertiges Tool von einer Boot-CD zu benutzen.