Der Explorer lässt sich (viel) Zeit

[Tyrael Y.]

Kann es sein, daß in der Zeit bis zum Erscheinen die Festplatte deutlich zu hören ist?

Es könnte sein, daß ein Sektor auf der Festplatte hinüber ist.
Windows versucht diesen Sektor mehrmals zu lesen und schickt sich selbst
irgendwann in den Timeout, dieser Vorgang kann lange dauern.

Wenn dies der Fall sein sollte, dann musst du die entsprechende Partition formatieren.
Bei der Formatierung erkennt das Betriebssystem, daß dieser Sektor fehlerhaft ist und
markiert es als "kaputt", so daß dieser Sektor nie wieder angesprochen wird.