Schonmal da wo's rot ist auf F1 gedrückt?
Aber nochmal zurück zur eigentlichen Sache: Normalerweise sollte Deine Software (wie ich das verstanden habe ist das ein normaler
FTP-Client?) ohne Probleme durch die Firewall durchkommen.
Auf der anderen Seite: Du sagtest der
FTP-Server stehe bei 'Euch Admins'. Schonmal dran gedacht, die Ausnahmeregel für die Firewall - so denn wirkliche eine absolut notwendig wäre - per Gruppenrichtlinie an die Clients zu verteilen? Also auf administrativer Schiene durchsetzen anstelle von hinten durch die Brust ins Auge zu entwickeln.