Moin Bernhard,
ich kann Dir jetzt leider nur sagen, wie's bis XP aussieht (inclusive).
In HKEY_CLASSES_ROOT wird eine Kombination aus HKEY_CURRENT_USER\Software\Classes (Datei NTUSER.DAT im Root des Userprofilpfades)und HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Classes (Datei SYSTEM im Verzeichnis System32\Config) angezeigt, wobei, die Einträge aus HKEY_CURRENT_USER Vorrang haben, so dass Classes Eintragungen userspezifisch sein können.
Wie gesagt, so sieht's bis XP aus, ich habe aber bislang noch nichts davon gehört, bzw. gelesen, dass es unter Vista anders wäre.
Nähere Einzelheiten findest Du
hier (HKEY_CLASSES_ROOT Key) und
hier (Merged View of HKEY_CLASSES_ROOT)