bei mir hilft es da meistens das Fenster so groß wie möglich (so wie ich's haben will) aufzuziehen (nicht Maximieren) und dann wieder zu schließen [X].
dann wurde bei mir jedenfalls die Einstellung der zuletzt beendeten IE-Instanz gespeichert und wird beim nächsten Öffnen des IE verwendet
Neustart war da jedenfalls noch nicht nötig ... 's muß nur der IE vollständig beendet sein