Ich würde auch eine Windows-Neuinstallation in Angriff nehmen.
Vllt. hast du auch ne Chance, wenn du z.B. mal mit einer Knoppicilin-CD
aus einer der letzten C't nen Virenscan machst. Versuch auch mal
Spybot Search & Destroy und
AdAware.
Du hast auch gesagt, dass ein Befall gemeldet wurde. Welche Dateien waren das denn?
Wichtig ist auch, dass du noch einen zusätzliche Software- oder Hardware-Firewall
installierst (Sygate Personal Firewall, ZoneAlarm, etc...).
Falls du eine Neuinstallation gemacht hast, würd ich auch alle Fälle
erstmal deine zweite Platte komplett scannen lassen.