Zu den 512 Bytes ... die Bootsektoren sind immer 512 Byte groß, denn darin steht ja unteranderem erst wie weiter auf die Platte zuzugreifen ist, also muß es da noch einheitlich sein, damit auch Ordnungsgemäß darauf zugegriffen werden kann
(wie die restlichen Sectoren aussehn ist dabei unerheblich)
Aber wenn das einem nicht ausreicht, kann man sich weitere Sectoren reservieren und darin dann den restlichen Bootcode unterbringen.
Wie das gemacht wird ist unterschiedlich und hängt von der Partition (FAT, NTFS ...) ab - falls nötig, empfehle ich ein Studium der entsprechenden Definitionen für den gewünschten Partitionstyp.
Ich weise da einfach mal auf die "Hidden sectors" hin
[add]
Ach ja, da du ja mit 'nem HexEditor, oder wie das war "rumpfuschst", sollte auch noch der Hinweis auf die letzten 2 Bytes im Bootsector fallen, denn das sind Prüfbytes und wenn die nicht stimmen, dann macht das BIOS nichts.
Und die restlichen Daten für die Art/Aufteilung der Partition sollten auch beachtet werden, sonst gibt's zwar 'nen Bootsector, aber mit der Partition ist nichts mehr anzufannen.