DBDesigner ist ein recht schickes Tool. (Open Source)
http://www.fabforce.net/dbdesigner4/
Man muss sich zwar bei manchen Sachen zuerst an die Bedienung gewöhnen, aber dann kommt man gut damit klar.
Bspw. ist das automatische generieren und löschen von Feldern beim Erstellen/Löschen von Relationen einerseits geschickt andererseits gewöhnungsbedürftig (wenn man die Felder zuvor schon drauf gesetzt hatte).