Moin Urban,
probier' es schlicht mal mit dem Extras-Menü aus dem Explorer.
Extras\Ordneroptionen\Dateitypen
Wähl die Endung dort aus, und ändere dann die Verknüpfung auf Dein Programm.
Ich vermute mal, dass das andere Programm eine
DDE-Verknüpfung aufgebaut hat, die Deine übersteuert.