Dein Fehler ist, dass du Benutzer und Anwendungen getrennt einliest. Das darfst du nicht tun, denn ich gehe mal davon aus, du willst den Benutzer als obersten Knoten, und darunter die Anwendungen, die auch bei ihm eingetragen sind.
Das heißt, du suchst mit einer "selectNodes"-Anweisung nach allen <benutzer>-Knoten. Die läufst du in der Schleife durch, und erst
dann suchst du für jedes gefundene Item nach den <anwendung>-Knoten.