erstmal installierst du ein sauberes system und sicherst es.
falls irgendetwas schief gehen sollte, spielst du deine sicherung wieder zurück.
Der MBR ist der erste Sektor einer Festplatte und 512 Byte groß.
Du kannst den MBR mit einem Hexeditor sichern und wieder zurückspielen.
http://www.mirkes.de/de/freeware/tinyhex.php
Lösch doch einfach die Partition, auf der das alte
OS lief.
Die neue Platte raus, alte Platte wieder rein, fdisk in Dos starten und die alte Partition löschen.