IMHO ist das für QR egal, solange der Druckbereich kleiner als die Ausgabefläche ist - was bei dir ja scheinbar der Fall ist. Ich denke eher dir spielen Randeinstellungen einen Streich. Wichtig ist jedoch im Treiber das richtige Papierformat gewählt zu haben.
Zumindest hatte ich ein ähnliches Problem mal mit einem Epson LQ680, was sich dann über die Einstellung im Treiber lösen ließ.