Danke für eure Infos.
Es ist offenbar schwierig zu umschreiben.

Meine Frage war eigentlich, ob sich ein Programm anders verhält, wenn man es einfach so startet oder ob man es in einen Thread packt und dort werkeln läßt. Vielleicht gibt es Threadeinstellungen, die ich nicht kenne.
Mittlerweile habe ich weitere Tests machen können und in dem Python Script, welches im Programm ausgeführt wird, eine Änderung vorgenommen. Offenbar gibt es im Programm Überschneidungen mit Schliessen von Dateien und dem gleichzeitigem Zugriff.