Wenn die "bestimmten Stellen" nur einen geringen Teil ausmachen, dann macht es bestimmt Sinn, nur diese zu konvertieren. Wenn es sich dabei um einen Großteil der Datei handelt, dann solltest Du wohl einfach alles konvertieren.
P.S. auch 100KB sollten auf heutigen Rechnern in Bruchteilen einer Sekunde zu schaffen sein.
P.P.S. Wie willst Du die Konvertierung machen. Keine Theorie, bitte den Code, ich kann testen