Ist es eine Totsünde im FormCloseQuery bei CanClose True eine globale Variable auf TRUE zu setzen, welche der arbeitende Thread dann abfragt, seine Arbeit beendet und "sich in Frieden beendet"?
So würde ich es machen.

Klar, man kann auch auf Terminated prüfen. Aber ich persönlich würde es mit einer eigenen Variable machen und den Thread an sich gar nicht erst anfassen.