Zunächst könntest Du die Gemauigkeit auf 0 ( = höchste Genauigkeit ) setzen und die Aufrufhäufigkeit auf 10 mSec

also von
mmResult := TimeSetEvent(50, 10, @TimeCallBack, DWORD(Self), TIME_PERIODIC);
auf
mmResult := TimeSetEvent(10, 0, @TimeCallBack, DWORD(Self), TIME_PERIODIC);

herabsetzen. Wenn Du die Routine nur alle 50 mSec ausführen möchtest, kannst Du intern einen Zähler von 1 bis 5 installieren und nur bei Zähler = 5 ausführen.

Dies löst aber wahrscheinlich nocht nicht das Problem, dass der Timer bei Mausbewegungen pausiert.
Dieses Pausieren habe ich bei Disk I/O auch schon feststellen müssen uns suche nach einer entsprechenden Lösung.