Das ist doch ganz normal. Selbst eingie MS Systemanwendungen sind bei mir mit Windows Vista markiert. Ich denke das besagt nur aus, ab welcher Windows Version das Programm läuft und kommt aus der Manifest Resource. Der Eintrag <supportedOS> ist dafür zuständig. Wenn man das ändert läuft das Programm auf Vista nicht mehr.
Siehe auch hier:
https://stackoverflow.com/questions/...ext-by-default