Wenn ich das richtig verstanden habe, gibt es alternativ nun einen 64-Bit-Compiler. Was der aber besser kann (außer dass ihm später der Speicher ausgeht) habe ich noch nicht verstanden.
Das ist im Wesentlichen der Vorteil: Man kann damit Projekte compilieren, bei denen der 32-Bit Compiler an seine Grenzen stößt.
Wegen der Einschränkungen, die mit MSBuild einherkommen, würde ich ihn nur einsetzen wenn unbedingt notwendig.