Ich habe mal versucht, das in ein Mini-Projekt auszugliedern.
Es scheint immer zu löschen, dass es mal die Keys behalten hat war wohl nur eine andere Einstellung in Project Magician.
Ich vermute es ist das Flag "Version Info".
Anbei mal beide Projekte, die Namen bitte nicht beachten, beide behalten die Android Maps apiKeys nicht.
T496_OptionsApiKey.zip
Gesetzt sind die Project Options so, sonst keine Group oder Global Options: