Merkwürdiges Öffnen einzelner Projekte

[Deep-Sea]

Du solltest keinen eigenen Code in die Projektdatei packen. Nicht, weil es etwa unsauber wäre, sondern einfach weil Delphi es nicht mag - wie man sieht.
Um so etwas wie die Verfügbarkeit einer wichtigen Sache zu testen kannst du dies woanders tun, z.B. in initialization-Abschnitten oder im OnCreate der Hauptform.
Beim OnCreate kannst du dein Problem gut lösen, finde ich. Solltest du dich beenden wollen, setze vorher auch noch Application.ShowMainForm auf false.