Ja genau.
Wenn dein Hauptthread nur so viel Daten aus dem Thread nimmt, wie er verarbeiten kann und dann immernoch etwas Zeit hat,
oder er nimmt sich z.B. 20 Dinge aud dem Array/Queue raus und macht dann immer mal einen kurzen
Sleep 
Delay)
dann läuft der Cache (dein Array/Queue) zwar langsam voll, wenn mal zu viel rein kommt, aber das Programm reagiert immernoch.
Andersrum kann der Thread aber auch langsamer werden, bzw. immer mal kurz pausieren, wenn der Hauptthread nicht mehr kann.
Oder kombiniert ... der Hauptthread macht so schnell wie er kann (nimmt sich z.B. alle 100ms so viel raus, wie er in weniger als dieser Zeit schafft) und der Thread pausiert, wenn ihm der Cache (Array/Queue) viel zu voll wird.
ODER
Es verarbeitet nicht der Hauptthread, sondern ein weiterer Thread,
dann reagiert das Programm auch immer, weil der Hauptthread ja nichts anderes macht, also mit dir zu reden und auf dich zu hören.
Weitergehend könnte man vielleicht dann auch gleich mehrere Threads verarbeiten lassen.
Der eine Thread holt die Daten, ein/mehrere Threads holen sich immer mal was aus der Queue/Array und ackern gleichzeitig
und der Hauptthread versorgt die
GUI und gibt deine Befehle an die Threads weiter.