Ja ich glaube das ist exakt mein Problem.
Ich habe nämlich auch vor ein PluginSystem zu bauen bzw. bin (bis auf dieses Problem) schon fertig. Auf das Problem bin ich auch nur gestoßen weil das ganze als Dienst läuft, der sich automatisch aktualisiert. Beim aktualisieren passiert folgendes:
Dienst beendet sich, Dienst startet sich neu, liefert die neuen DLLs aus (hängen als Resource dran) und läd die DLLs.
Mein Problem dabei ist nur, dass die DLLs beim beenden des Dienstes zu langsam freigegeben werden, wenn man FreeLibrary nicht nutzt, weswegen die DLLs beim Dienst-Neustart nicht überschrieben werden können.
Aber gut, dann denke ich nutze ich deine Lösung: Ich ignoriere FreeLibrary einfach und löse das andere Problem durch einen "Abwarten" Timer
Vielen Dank!