klar, du kannst erstmal in Beiden das selbe Submodul einbinden, aber niemand schreibt dir vor, dass es der selbe Branch sein muß.
Da könnte man dann entweder jeweils manuel das Submodul updaten (commit+push oder pull) und den Submodul-Link inkl. der
GUID des aktuellen Commits im jeweiligen Hauptrepo committen.
Jedesmal, wenn du das Submodul aktualisierst, mußt du um Hauptrepo die neue
GUID mit committen.
(das ist im Prinzip das Standadvorgehen, seitens GIT ...
bei SVN konnte man das einfacher verlinken, z.B. sagen das der aktuelle Stand zu einem Tag oder was Anderem genommen werden soll ... da nam sich das Hauptrepo automatisch den jeweils aktuellen Stand ... hat Beides Vor- und Nachteile)
Alternativ kannst auch mit Branches je Hauptrepo arbeiten, beim Checkout wäre dann jeweils der letzte/vorherige Stand passend zum Commit-Date der Hauptrepos zugehörig.
So kann es auch mal etwas auseinander laufen, wenn einer der Hauptrepos noch nicht mit dem aktuellen Submodul kompatibel ist.
Bei Branches wäre mit aktuellem Hauptrepo immer der jeweils aktuelle Commit im jeweiligen Branch zugehörig.
Nur beim zurückgehen kann man sich dann überlegen, ob man die committete
GUID oder einfach das Commit-Date des Submodules nimmst