Ich hab jetzt mal in meinen Code geschaut und 3 sollte richtig sein, da PNG Chroma und Alpha trennt. Das macht auch ein nachträgliches CreateAlpha einfacher, denn PngDelphi muss nicht jeden Pixel vergrößern.
Letzteres kannst du ausnutzen, wenn du ganz sicher gehen willst: Du erstellst ein
RGB-Bild, kopierst seine verdrehten Scanlines - denn die Pixelgröße ist zu diesem Zeitpunkt garantiert nicht 4 Byte - und sagst dann CreateAlpha. Danach kopierst du die verdrehten Alpha-Scanlines.