Wenn nicht
zeitgleich an beiden Monitoren/Eingabegeräten gearbeitet wird, dann wird es einfacher.
Das Fenster doppelt (je Monitor) und nur bei der Tastatur muß man aufpassen, dass nicht grade das andere Fenster den Fokus hat (vorher einmal ins Fenster klicken oder eine Erkennung der Quelle und automatische Fokusierung des richtigen Fensters).
Wie schon gesagt.
Entweder mußt du auf tieferen Ebenen auf Eingaben reagieren, also dort wo du die Quelle der Inputs unterscheiden kannst, damit jedes Fenster auf eine andere Touch/Maus/Tastatur reagieren kann.
Oder man nehme einen billigsten MiniPC, auf dem ein RDP-Client läuft und sich in eine zweite Session auf dem PC einloggt.
Das Programm also zwei Mal gestartet, je in einer eigenen Session auf einem der Monitore.
Oder (hier macht die Trennung der Eingabegeräte/Anzeigen ein anderes System und nicht du selber)
https://de.wikipedia.org/wiki/Mehrplatzrechner
Im Linux isses einfacher. Dort kann man wohl eine X-Session mehrfach starten, auf nur einem der Monitor anzeigen lassen, und jeder Sizung eine andere Maus/Tastatur/Touchgerät zuweisen.