Sollte wohl nicht das Problem sein, wenn ich eine neue Datei anlege. Trotzdem danke.
Inzwischen habe ich etliches gelöscht u.a. die *.dproj. Nachdem ich diese wieder zu compilieren geschafft habe sind die blauen Punkte da.
Meistens ist das eine Einstellung eben genau in der .dproj Datei. Die genaue Ursache sollte sich beim Vergleich der neuen funktionierenden Datei mit der alten Version aus dem Repository finden lassen. Bzw. wenn du eine der letzten Versionen auscheckst, sollte sich ja auch zeigen wo der Unterschied lag.
Es macht auch Sinn beim Einchecken der .dproj Datei die gleiche Sorgfalt wie für andere Quelltextdateien walten zu lassen und jede Änderung vor dem Einchecken zu überprüfen. Leider werfen manche diese einfach ohne Prüfung ins Repository, was dann auch mal Probleme wie dieses verursacht.