beim Login via RDP wird für den Benutzer jeweils das S: verbunden.
Hast du die Möglichkeit es mal testweise auf einem lokalen Laufwerk zu probieren?
Ansonsten sind deine Versionen jeweils schon etwas betagter. Falls du - wie auch wir in der Firma - einen gewissen Grund haben solltest ein Upgrade zu scheuen, bspw. weil das Git-Wire-Protokoll unterstützt werden muß, dann hilft auch eine Aktualisierung.
Die Version in TortoiseGit bezieht sich also auf libgit2 oder gibt's da echt noch ein weiteres installiertes Git? Da einige der Unterbefehle von Git ja als externe Binaries (und Skripte) implementiert sind, könnte das schon das Problem sein. Kannst du hilfsweise mal ein installiertes Git "ausschalten" indem du bspw. das Verzeichnis umbenennst?
Ansonsten auch nochmal probieren Git zu aktualisieren.