Pack den Ordner da hin, wo es für dich übersichtlich ist

In den Beispielprojekten sind relative Pfade angegeben, da ist es also nur wichtig, dass die Verzeichnisstruktur intakt bleibt.
Zum Installieren:
Wenn ich das "D103Install" Gruppenprojekt lade, wird bei mir oben rechts die Projektübersicht angezeigt. Da sind zwei Projekte drin:
OverbyteIcsD103Run.bpl
OverbyteIcsD103Design.bpl
Das müsste bei dir auch so sein, oder?
Die Runtime hast du ja schon erstellt. Nun noch mit rechter Maustaste auf das Design-Projekt klicken und in dem Kontextmenü "Installieren" ausführen.