Sind im
SDK Manager alle Einträge
SDK/NDK/JDK korrekt (keine gelbes Dreiecke, und wenn Du den Dateilladen button drückst ist er im richtigen Verzeichnis) ?
Die AndroidNDK-17b_20.0.
34749.6593 und
SDK liegen u.U. an doch anderen Stellen,
wenn Du das neben das alte 10.3.2 installiert hast.
Ich mache immer einen cleanen Install in eine VM, da wird dann alles so wie von -Setup vorgeshen installiert.