Wie groß sind die die "Files" die du damit überträgst ?
Ich denke auch das der ATMega damit leicht überfordert ist.
Du könntest in deinem Design womöglich auch einen Zusatzchip einsetzen,
hier FTDI, aber es gibt auch zig andere externe Lösungen.
Nur läuft das dann fast drauf hinaus, NICHT den AVR, und gleich einen schnelleren Controller zu nehmen.
Rollo