Also ich tipp ja (mal wieder) stark auf "Versionskonfusionismus" bei der dproj-Datei. Mach ein Backup von dem Projekt, lösche die dproj und öffne das Projekt über die dpk. Dann die Projektoptionen nachkonfigurieren falls nötig. Das hat bei mir schon in vielen derartigen Fällen Wunder bewirkt. Auch wenn das Nachkonfigurieren lästig ist, schneller als das
XML-Gefuddel in der dproj ist es meistens doch.
EDIT: Was mir grad noch einfiel: Hast du das Icon vielleicht beim falschen Plattform-Target eingestellt? Also z.B. das Icon bei Windows 64 Bit konfiguriert und dann für Windows 32 Bit kompiliert?