Ich mach bei uns auch sowas, also zwei Fenster untereinander.
Meine Lösung, vorallem da unsere Fenster nicht gleich breit sind:
Ein bisschen Abstand lassen und dann ist es egal, ob dazwischen 12 oder 16 Pixel liegen.
PS: Die Delphi-
IDE ist bezüglich der Positionierung selber nicht vorbildlich.
ALLE anderen Programme machen keine Probleme, aber nach jedem RDP-Login vergisst Delphi sein Vollbild und schiebt sein Fenster ein bissl nach Rechts-Unten, so daß dann ein Teil des Fensters auf dem rechten Monitor landet und sich das da nichtmal anklicken lässt.
Außerdem macht Delphi da noch soooooooo viele Refreschzyklen und scheint Vieles mehrmals neu zu zeichnen, so dass das Fenster dann mehrere Sekunden wild flackert und manchmal 1-2 Minuten auf nichts reagiert oder gar komplett für immer hängen bleibt.