Die Begründung in diesem Thread halte ich für Unsinn. Nur weil da steht "Das BSI sagt ...", heißt das nicht, dass man das auch glauben soll.
Stimmt, das BSI ist nicht die letzte Autorität zu dem Thema; im Regelfall sind die eher zu gnädig bei Sicherheitssachen. Aber nicht nur das BSI warnt, eigentlich hört man das von allen Experten zu dem Thema.
MD5 selbst ist ja nur ein Baustein - es wird wohl niemanden geben, der versucht, ein Haus mit einem einzigen Ziegelstein zu bauen.
Allerdings würde auch niemand bröckelige Ziegelsteine verbauen, wenn er genügend stabile Ziegelsteine hat.