Was heisst "Unterfenster"? Ist das eine
MDI Anwendung, von der du sprichst? Oder öffnet das Programm eine eigenständige neue Form?
Du kannst mit WinSpy auch die Fensterklasse finden lassen und dann mit FindWindow nach der Klasse suchen. Oder
FindWindowEx wäre evtl. auch eine Möglichkeit.