Ich kann mir allerdings nicht vorstellen, was da sooo unterschiedlich ist und was man dagegen machen könnte.
Vielleicht hat ja jemand eine Idee!
Dalai hat schon das richtige Stichwort gegeben
Wenn du in deinem 32 Bit Ersatzexplorer in das C:\Windows\System32 Verzeichnis navigierst, landest du in Wirklichkeit (vollkommen transparent) aber in C:\Windows\SysWow64.
Das System lenkt Zugriffe von 32 Bit Prozessen auf den System32 Ordner automatisch nach SysWow64 um, damit Dlls und andere Resourcen ohne viel Aufwand vom Programm geladen werden können. System32 und SysWow64 enthalten zum Großteil die selben Dateien, nur dass in System32 alles für 64 Bit - und im SysWow64 alles für 32 Bit kompiliert ist. Bei den Treibern macht es keinen Sinn eine 32 Bit Version beizulegen, da der Kernel sowieso nur 64 bit Kompilate laden kann.
In deinem eigenen Programm kannst du dieses Verhalten über die
Wow64DisableWow64FsRedirection API deaktivieren (nur für den aufrufenden Thread, wenn ich mich recht erinnere).