Man kann mit Acrobat einstellen das man die Anzeige immer außerhalb des Browser haben will.
Da aber bei dir die
GUI vom Reader nicht passt glaube ich das der IE im walde mit seinen Einstellunge ist.
Im Einstellungsdialog gibts einen Button "Zurücksetzen". Das hat mir schon bei ein paar Kunden geholfen bei der der IE "lost in Settings" war.