Das sind die Installationsdateien, die noch benötigt werden, wenn Du z.B. aus dem Paket etwas nachinstallieren oder entfernen möchtest. Löschst Du die, dann funktioniert das alles nicht mehr und Du musst bei Änderungen alles neu installieren (könnte schon sein, dass die Deinstallation auch nicht mehr richtig funktioniert).
Was installiert wurde, das sollte wo anders stehen.
Dort drin liegt nur eine Kopie vom Setup und für's Nachinstallieren kann man auch das Original verwenden, oder man läd sich das Setup neu runter.
Egal welches Setup man startet, es wird zuerst geschaut was installiert ist und demnach müssten alle Installer gleich reagieren, egal wo sie liegen.
(solange man natürlich die selbe Version verwendet)
Deinstallation über die Windows-Programmeverwaltung würde natürlich ins Leere zeigen und nicht mehr funktionieren, aber man kann ja auch über die anderen Installer deinstallieren, sogar übere den Online-Installer müsste es gehn.