Hallo Klaus,
Je nachdem ob Ordner und Unterordner rekursiv durchlaufen werden, kann das ja durchaus zu unterschiedlichen Reihenfolgen bzw. Formatierungen der Checksummen führen, oder?
Wenn für jede Datei ein Prüfsumme errechnet wird, sollte die Dateireihenfolge keine Rolle spielen.
Ich würde es auch vorziehen, die Dateien einzpacken (tar, gz) und dann über das Archiv eine Prüfsumme bilden.
md5sum windows und md5 Mac sollten gleiche Ergebnisse liefern, sonst würden die Prüfsummen meines Erachtens auch keinen Sinn machen.
Grüße
Klaus