Ich beantworte meine Frage mal selbst falls jemand das selbe Problem hat.
Die embedded Version nutzt normalerweise den IE 7 als Engine. Mit Hilfe eines Eintrages unter
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Internet Explorer\MAIN\FeatureControl\FEATURE_BROWSER_EMULATION
wird das geändert, damit immer die jeweils aktuellste installierte Version verwendet wird:
http://www.west-wind.com/weblog/post...the-IE-Version