Also wenn du konkrete Fahrpläe außen vor lässt, ist das relativ einfach: Das Netz lässt sich als Graph auffassen. Ein Knoten sit dann eine Haltestelle, und eine Kante ist eine Transportmöglichkeit (Verbindung) zwischen zwei Haltestellen.
Eine Buslinie würdest du dann erstmal aufteilen, welche Haltestellen mit welchen Kosten verbunden werden. Die Kanten kannst du dann in den Graphen einsortieren.
"Kosten" ist hier übrigens ein etablierter Begriff, meistens haben die Kanten definierte Kosten und es wird dann der günstigste Weg gesucht. Dafür eignet dich der Dijkstra-Algorithmus. Er bekommt zwei Knoten und rechnet dir dann den kürzesten Pfad (= geringste Kosten) aus.
Was zum Lesen gibt es hier:
http://de.wikipedia.org/wiki/Graph_(Graphentheorie) bzw. hier:
http://de.wikipedia.org/wiki/Dijkstra-Algorithmus oder einfach hier nachfragen
