Wir nutzen hier Eclipse PDT zusammen mit XDebug bzw. ZendDebug - je nach dem auf welchen Server die Anwendungen laufen (Zend-Server/eigene Apache).
Mit Netbeans nutzen wir auschließlich XDebug, da das nicht gut mit Zend-Debug kann.
Die IDEs sind vom Leistungsumfang und von möglichen zusätzlichen Plugins ähnlich.
z.B. Integration von PHP-
Unit, CodeSniffer, MessDetector u.a.