Indem du das, was nicht enthalten sein soll, auch nicht in das Ergebnis aufnimmst?
> look-ahead assertion ...(?=...)
und
> look-behind assertion (?<=...)...
Code:
(?<=MyFunction\()\d+(?=\))
(?<=MyFunction\()[0-9]+(?=\))
[edit]
falsch verstanden...
Wieso sollte es denn die ganze Zeile liefern?
Wenn man nur nach "MyFunction\(\d+\)" sicht, dann bekomme man eigentlich auch nur "MyFunction(...)" raus.
Wenn nicht, dann machst du was falsch und da keiner verraten hat, wie er es macht, wissen wir auch nicht was er falsch macht.