Vorher ein
OS installieren (damit ist der Bootsektor da) und dann die anderen Dateien kompieren.
Wie sehen die Zugriffsrechte der kopierten Verzeichnisse aus?
Wurden auch alle versteckten Dateien kopiert und auch die, worauf ein normaler Benutzer und nichtmal ein Admin Zugriff hat?
Da du die Originalrechte vermutlich nicht hinbekommst, könntest du einfach mal alle Rechte entfernen und auf "Jeder" stellen.