Danke, aber das hat mich leider geschwindigkeitstechnisch nicht voran gebracht.
Ich mache es jetzt so, dass ich beim Resize die InnerControls ausblende und die Controls im Designer temporär "leer" darstelle.
Gleichzeitig werden diese in eine Liste aufgenommen und nach und nach mit dem Inhalt ergänzt.
Das ist auch noch nicht ganz optimal, aber zumindest erträglich.
Wenn jemand später mal noch Tipps dazu hat, dann immer her damit.